Agent 47 je nova, bolja i opasnija verzija svoh predhodnog klona Agenta 46. U njemu se krije neponovljiva brzina, snaga kao i natprosječna razina inteligencije. Na njegovoj meti je ogromna korporacija koja pokušava da razotkrije njegove tajne iz prošlosti te žele na taj način stvoriti cijelu armiju opasnih i nemilosrdnih ubojica. Agent 47 će saznati puno o svom porijeklu, možda i puno više nego što on sam želi znati. Na njegovom putovanju upoznaje zgodnu djevojku koja ima vrlo bitne informacije za njega.